Η κλήρωση του Κυπέλλου Γ’ Εθνικής στον 3ο όμιλο στην α’ φάση και οι συνεχείς διασταυρώσεις: 
(Ν.16) Χαλκίδα-Αχαϊκή 
(Ν.17) Ζευγολατιό-Θήβα 
(Ν.18) Τσικλητήρας Πύλου-Παναχαϊκή 
(Ν.19) Παναρκαδικός-Μεγαλόπολη 
(Ν.20) Παναργειακός-Ερμιονίδα 
(Ν.21) Αμαλιάδα-Λουτράκι 
(Ν.22) ΠΑΟ Βάρδας-Αιολικός 

2η φάση 
(Ν23) Νικητής 16-Φωστήρα 
(Ν24) Νικητής 17-Νικητής 20 
(Ν.25) Νικητής 21-Νικητής 19 
(Ν26) Νικητής 18-Νικητής 22 

3η φάση 
(Ν27) Νικητής 24-Νικητής 26 
(Ν28) Νικητής 25-Νικητής 23 

Τελικός που θα γίνει σε ουδέτερη έδρα 
Νικητής 27-Νικητής 28 

Η κλήρωση της α” φάσης του Κυπέλλου Γ’ Εθνικής στον 4ο όμιλο (16-10-2016 ): 
(Ν16) Ρόδος-Ιαλυσός 
(Ν17) ΠΟΑ-Ερμής Ζωνιανών 
(Ν18) ΙΝΚΑ-Εργοτέλης 
(Ν19) Κηφισιά-Προοδευτική 
(Ν20) Ηλυσιακός-Ιωνικός 
(Ν21) Άγιος Ιερόθεος-Θύελλα Ραφήνας 
(Ν21) Τριγλία Ραφήνας-Εθνικός Πειραιά 

Στην 2η φάση οι διασταυρώσεις (13-11-2016)
(Ν23) Νικητής 21-Νικητής 22 
(Ν24) Νικητής 18-Νικητής 19 
(Ν25) Πανθηραϊκός-Νικητής 16 
(Ν26) Νικητής 20-Νικητής 17 

Στην 3η φάση 
(Ν27) Νικητής 23-Νικητής 24 
(Ν28) Νικητής 26-Νικητής 25 

Τελικός Ομίλου που θα γίνει σε ουδέτερη έδρα 
Νικητής 27-Νικητής 28